En decisión que lo define, el rey FELIPE IV de Francia ha enviado al mismo NOGARET a Roma con la orden de prender al papa y llevarlo a París para ser juzgado. BONIFACIO VIII es informado del plan y prepara la bula Super Petri solio en la que se excomulga al rey de Francia. Pero Nogaret también está bien informado del accionar del papa.

Guillermo de NOGARET, ayudado por Sciarra Colonna y otros «gibelinos», hace una incursión relámpago en Anagni donde se encuentra el papa por ser su residencia veraniega y, en la fecha, captura al Papa BONIFACIO VIII (“Atentado de Anagni”). “Aquí está mi cuello, aquí está mi cabeza” dice el pontífice a su secuestrador, cuando éste aparece con sus hombres en el salón del trono.

BONIFACIO VIII ha sido liberado pero no puede superar la dolorosa impresión de aquel incidente y pocas semanas más tarde, en la fecha, muere. Con su muerte, el poder temporal de los Papas empieza a debilitarse. Su pontificado representa el fin de la pretensión de dominio universal de la Iglesia Católica frente a los poderes monárquicos de las nacientes naciones de Europa. Las profecías de San Malaquías se refieren a este papa como Ex undarum benedictione (De la bendición de las olas), cita que hace referencia tanto a su nombre de pila, Benedetto, como al hecho de que en el escudo de armas de su familia aparecen unas olas. Después de Bonifacio VIII, sin embargo, sus sucesores conservaron fuerza espiritual y aún pudieron actuar utilizando a gobernantes seculares adictos, pero nunca más volvieron a reclamar verdadero poder sobre las naciones.