El papa INOCENCIO IV, provoca el alzamiento contra el emperador, FEDERICO II, de muchas ciudades del norte de Italia, obteniendo la victoria las tropas papales el 26 de mayo de 1249.

A mediados del siglo XIII, las pretensiones del pontificado están claramente definidas. El Vicario de Cristo, INOCENCIO IV, sucesor de Pedro, ejerce una autoridad absoluta sobre la vida religiosa de toda la comunidad. Este poder espiritual es superior a cualquier autoridad temporal. Los príncipes temporales poseen, desde luego, autoridad para gobernar a sus súbditos, pero sólo pueden ejercer esta autoridad si acatan las normas dictadas por el Papa. La más importante de éstas es que el Imperio sólo puede ser conferido a un candidato aprobado por la Santa Sede. La prolongada lucha entre ambos poderes empezada con Enrique IV, ciento setenta y cinco años antes, ha quebrantado la fortaleza imperial. En lo sucesivo, aun cuando el Imperio esté regido por una personalidad fuerte, permanecerá sometido al Papa.

Muerto Federico en 1250, lo sucede su hijo más joven CONRADO IV (1250-1254). Añadirá a su título de rey de Sicilia el título imperial con la oposición del Papa INOCENCIO IV -que no concederá la coronación- que queda atrapado entre los dominios de un solo monarca. Su reinado se caracterizará por las convulsiones que sacudirán Alemania, donde parte de la nobleza se niega a reconocer la autoridad de los Hohenstaufen y, apoyada por el Papa ha escogido, en vida aún de Federico, a GUILLERMO de Holanda como emperador.

Muerto Federico II, el papa INOCENCIO IV continúa su lucha contra CONRADO IV, hijo y sucesor de Federico II.

El Papa INOCENCIO IV regresa a Roma. Las rivalidades políticas entre los emperadores alemanes y el papado por la hegemonía sobre Italia ha dominado la vida política de la península italiana durante siglos. A menudo, en el interior de cada estado italiano, esta rivalidad ha adquirido una dimensión de conflicto civil. Se trata de las luchas entre güelfos (partidarios del papa) y gibelinos (partidarios del emperador).

El papa INOCENCIO IV en la bula Ad extirpanda autoriza el uso de la tortura para obtener la confesión de los reos. En ningún caso puede mutilarse al reo ni poner en peligro su vida. Las penas son variables. Los herejes relapsos son entregados al brazo secular para la ejecución de la pena de muerte. Desde luego, el papa no emplea la palabra “tormento” pero se adivina en el texto la posibilidad de su aplicación. Nada hay en el texto del papa INOCENCIO IV que hable del potro o de la estrapada y los únicos métodos usados en Languedoc más de medio siglo después son estricto confinamiento y privación de alimentos. En otros sitios, el permiso de INOCENCIO IV se interpreta como “carta blanca” para que los inquisidores obtengan informes por medio de los usuales tormentos, los cuales, no obstante, son aplicados por funcionarios seculares. Esta última restricción es causa de dilaciones y de ineficacia, no tardando en quejarse los Inquisidores contra la ley canónica que prohibe al clero, bajo pena de irregularidad, incluso el estar presente en la cámara del tormento.

Las leyes canónicas condenan las confesiones obtenidas mediante el dolor. El sentimiento general es que los sacerdotes no deben tener nada que ver con el tormento. Pero al ir transcurriendo el tiempo y ver que el enemigo sigue invicto y que hasta audazmente quita la vida aqui y allá a varios inquisidores, los que están consagrados a esta peligrosa tarea advierten cada vez mejor que están dedicados a una guerra contra un enemigo implacable y habilísimo. Como en todas las guerras, la tendencia reactiva es la de emplear métodos aún más despiadado

Los Carmelitas han buscado desde Aylesford, Inglaterra, propagar su espiritualidad por el continente europeo. Ahora, INOCENCIO IV concede a los Carmelitas el privilegio de ser incluidos entre las Órdenes mendicantes (junto con los Franciscanos y Dominicos).

El gobernante de Apulia, MANFREDO, hijo bastardo de Federico II, sospecha de la conducta del pontífice cuando visita su nueva tierra, por lo que huye con los sarracenos, que le ayudan a derrotar a las tropas papales en Foggia el 2 de diciembre de 1254.

INOCENCIO IV, enfermo, fallece en Nápoles el 7 de diciembre, como consecuencia del efecto que la noticia de la derrota tiene en su desastrada salud.