Ante la excomunión recibida del papa GREGORIO VII, ENRIQUE IV reacciona violentamente y en junio del mismo año, en Brixen hace nombrar por sus obispos antipapa a GUIBERTO, obispo de Rávena que toma el nombre de CLEMENTE III (25.6.1080-8.9.1110).

ENRIQUE IV en el verano de 1084, después de prolongado asedio, entra en Roma. El Papa GREGORIO VII se refugia en el castillo de Santángelo. El antipapa CLEMENTE III es puesto en la cátedra de San Pedro, y, naturalmente, se apresura a consagrar a ENRIQUE IV como emperador (1084-1106). La suerte de ENRIQUE parece ya fijada; pero ROBERTO Guiscardo, el Zorro, acude en ayuda del Papa.

El papa GREGORIO VII que se ha retirado a Salerno, es fama que antes de morir -en la fecha- perdona a todos sus enemigos, excepto a ENRIQUE IV y al antipapa CLEMENTE III. Sus últimas palabras han sido una dolorosa adaptación del salmo 44. Dijo GREGORIO VII: “He amado la justicia y odiado la maldad, por eso muero en el destierro”. Años más tade será canonizado como el “más resuelto defensor de la libertad de la Iglesia” y el Cardenal Pedro Damián, también un santo, le llamará “santo satanás”, refiriéndose a su implacable energía. El conflicto de las investiduras entre el papa GREGORIO VII y el Emperador ENRIQUE IV ha impedido al papa poner en práctica su proyecto mas anhelado: reunir un gran ejército, ponerse él mismo al frente y dirigirse hacia Oriente para detener el avance de los sarracenos. No es ni un sueño ni una quimera. Es un grandioso plan estratégico. Si ese ejército es capaz de aliviar la presión del Islam sobre el Imperio de Bizancio, tal vez las Iglesias de Oriente y de Occidente se reconcilien. Y sobre todo: se ha de liberar Tierra Santa… “Prefiero recuperar los Santos Lugares -dijo- que gobernar el mundo entero”.

Aunque el antipapa CLEMENTE III ocupa el palacio de Letrán, los cardenales se reúnen a la muerte de Gregorio VII y eligen para sucederle a uno de sus más firmes seguidores Desiderio, abad de Montecassino. Pero éste, dolido por las injusticias cometidas contra su antecesor y ante la desoladora situación de la Iglesia de Roma, se niega, por dos veces, a aceptar la investidura, necesitándose una tercera elección para decidirle a aceptar, tomando el nombre de VÍCTOR III (24.5.1086- 16.9.1087).

La duquesa MATILDE, con ayuda de los normandos, expulsa de Roma a CLEMENTE III y el nuevo pontífice -VÍCTOR III- ve así despejado el camino para el ejercicio de su misión. Confirma la excomunión contra ENRIQUE IV ordenada por Gregorio VII.

URBANO II -papa- (12.3.1088 – 29.7.1099). El Papa URBANO II, francés de origen, es monje benedictino y ha sido prior de Cluny y cardenal. Desde el primer momento, URBANO II se manifiesta como un estricto continuador de la política llevada a cabo por Gregorio VII, llegando a decir en su primer acto como Pontífice que “todo lo que él rechazaba, yo lo rechazo, lo que él condenaba, yo lo condeno, lo que él amaba, yo lo abrazo, lo que él consideraba como verdadero, yo lo confirmo y apruebo”. Su llegada a Roma se ve complicada por la fuerte oposición del emperador de Alemania, ENRIQUE IV y el antipapa CLEMENTE III, que había ocupado la ciudad. Sin embargo, consigue el apoyo de los normandos del conde Roger I tras una visita relámpago a Sicilia, lo que le permite entrar definitivamente en Roma, aunque debe combatir durante tres días con las tropas del antipapa antes de poder llegar a la Iglesia de San Pedro. Durante este difícil acceso al solio, URBANO excomulga a CLEMENTE III y al emperador ENRIQUE IV, que se ha aliado con él.

En los años siguientes tratará de recuperar su antigua esfera de influencia en Alemania, en clara confrontación con el emperador. Para ello, casará a la anciana condesa viuda Matilde de Toscana con el conde Welf de Baviera, de apenas 18 años, con el fin de que unan sus fuerzas en la guerra contra Enrique IV en el norte de Italia. También sancionará que no se puede obligar a los eclesiásticos a jurar fidelidad a autoridades laicas, lo que tendrá grandes consecuencias en siglos posteriores. A pesar de estos esfuerzos, en 1089 se ve obligado a abandonar Roma, que vuelve a ser ocupada por CLEMENTE III, y pasa los tres años siguientes convocando diversos sínodos en Amalfi, Benevento y Troia, en los que adoptará medidas contra la simonía, la ley de las investiduras y el matrimonio de eclesiásticos.

Fallece el antipapa CLEMENTE III.